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时娟随口介绍了一下:“老板,这是我们从j带回来的样本,一共一百四十四种,现在需要对它们进行基因测序。”
这是育种4.0的前置工作。
育种4.0就是应用基因型大数据、表型大数据、环境大数据建立模型,并进行大量计算机模拟,以寻求在全基因组水平上对已知的不同位点等位基因的最佳组合。
它需要两个大前提,一个是超级计算机的海量算力,第二个就是基因组数据库。
马兰草的算力是有的,基因数据库是没有的。
这玩意耗资大,时间久,国内主要做了农作物的基因组测序,还有少量经济作物。
马兰草这种价值低的近似于野草的植物,是没有做测序的。
所以就得自己来。
文英他们现在就是在准备样本,然后构建dna文库。
接着才是测序。
测序完了还要进行数据预处理、序列比对、变异检测、功能分析,并将结果可视化。
复杂着呢。
而接下来dna文库构建是最关键的一步。
在这个步骤中,会将提取的基因组dna随机打断成小片段,并进行末端修复等等。
育种4.0所需要的全基因组甲基化测序,还需要进行bisulfite处理。
处理后才可以绘制出全基因组的dna甲基化图谱,进而分析甲基化模式与特定表型之间的关联。
反正就是很麻烦,很耗时,还特殊,只能自己做,涉及到保密嘛。
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